Zatím všechny díly Vetřelce jsou k vidění ve dvou verzích, zatím poslední díl přinesl nejméně výrazné vylepšení. Oproti kinoverzi máte sice možnost vidět jiné úvodní titulky a na konci spatřit futuristickou Paříž, přesto se jedná veskrze o kosmetické vylepšení.
Úvodní titulky
V původní verzi podkreslují titulky detailní záběry na nepovedené klony (což ale zpočátku nevíme), ve speciální edici popustil Jean-Pierre Jeunet uzdu své fantazii. Povědomé zuby v prvním záběru by sice mohli patřit vetřelci, po odjetí kamery vidíme, že se jednalo o velice detailní záběr brouka, a po dalším odjetí vidíme, jak brouka zabijí pilot sedicí v jednom z modulů Aurigy. Po skončení titulků už se přesouváme ke známému inkubátoru s Ripley. Tam je ještě navíc věta převzatá z Vetřelců „Máma mi vždycky říkala, že žádná monstra nejsou“.
Vzpomínky
Když vědci ukazují čerstvě naklonované Ripley obrázky a ona má hádat, co na nich je, kromě rukavice a třešní následuje ještě jeden obrázek s portrétem malé holčičky. Ripley zaváhá a ve tváří se jí objeví bolestný výraz. Je to v okamžiku, kdy se generál Perez baví s vědci, za má naklonovaná Ripley nějaké vzpomínky.
Zbraně
Těsně před tím, než se parta rozhodne plavat skrz zatopenou kuchyň, voják Distephano a Christie se baví o zbraních. Distephano obdivuje jeho zbraně, co nejsou zachytitelné na senzorech a zároveň umí střílet i pod vodou.
Rozhovor
Dialog mezi Call a Ripley v katedrále je obohacen ještě o několik okamžiků. Ripley se ptá Call, proč se tak snaží zachránit lidstvo a navazuje tím, že také ona se kdysi o něco takového pokoušela. Zároveň zmiňuje dívku, co měla zlé sny a snažila se jí zachránit. Nepadne ovšem její jméno a Ripley sama přiznává, že si ho už nepamatuje.
Paříž
Kinoverze končí v okamžiku, kdy Betty vstupuje do zemské atmosféry. Ve speciální edici vidíme ještě jak dosedá přímo na zemský povrch. Ripley a Call se baví o tom, co bude dál, obě uvažují, že rychle zmizí, než se někdo objeví. Poslední záběr nám ukazuje, že sedí před furuturistickou poničenou Paříží.