Zatímco želvy pracují na použití fragmentů Vortex Crystal ke stabilizaci svých mutací, Lord Dregg plánuje použít fragmenty k vytvoření dalšího Vortex Crystal k napájení svého Vortex Transporteru. Mezitím je Dreggův druhý velitel, HiTech, vystřelen do vesmíru, aby jej nahradil jeho nejlepší vědec Dregg, Mung, jako jeho nový velitel.