Pořád se nedaří zastavit replikátory, kteří pokračují ve vyhlazování planet. McKay společně s Wraithem pracují na kódu, který by měl vypnout útočení replikátorů. K Atlantis doletí i Daidalos s Apollem, na kterých jsou nainstalovány asgardské zbraně, těmi pár lodí neutralizují. Jenže replikátoři ustupují ke své domovské planetě, kde budou v přesile. Rodney má nápad – místo přerušení spojení mezi jednotlivými bloky replikátorů udělá opak, chce, aby se bloky přitahovaly. Velká bitva proti replikátorské planetě na sebe nedá dlouho čekat.

Sheppardův tým evakuuje lidi z planety M9R-373, ale útok Replikátorů už začne a 2 000 lidí je ztraceno. Na Atlantis přilétají Apollo a Daedalus s novými Asgardskými zbraněmi a McKay dostává lhůtu 10 hodin na dokončení viru, jinak musí použít zbraně. To ovšem Rodney s Toddem nestihnou a nakonec se podaří zničit 6 Replikátorských lodi, než změní taktiku a stáhnou se na Asuras. McKay má ale plán posílit vazbu nanitů a ty by se pak přitáhli k sobě do jednoho supertěžkého bloku. Museli by ale zaměstnat všechny jejich lodě na orbitě. Todd by mohl poskytnout 12 lodí a Sheppard to letí na jednu jejich loď projednat. Později také kontaktuje Cestovatele a ti jim také poskytnou pomoc. Na Atlantis zatím Rodny marně zápolí s programem, protože nanity nedrží soudržnost. Má ale další plán a sestrojí tajně lidského Replikátora a všichni jsou šokováni. Teyla také prozradí, že je těhotná a Sheppard ji odvolává ze služby. Replikátor ale najde chybu v plánu Rodneyho, protože se přizpůsobí dříve, než dosáhnou kritické hustoty a navrhne jiný plán. Sama se stane zdrojem, musí přetížit půl tuctu ZPM, čímž bude celá planeta také zničena a musí zabránit lodím v úniku hyperprostorem. Flotila dorazí na Asuras a největší vesmírná bitva začíná.