John Sheppard se od plukovníka Carterové dozvídá o úmrtí svého otce. Cestuje tedy společně s Rononem bránou z Atlantis na Zemi. Na pohřbu potká dívku, která ví až moc informací o tajném projektu s využitím nanitů. John a Ronon zjistí, že se na Zemi s nanity experimentovalo a že vznikla lidská forma replikátora. Ten však utekl a je velmi nebezpečný. Sheppard tedy rozjede po uprchlém replikátorovi pátrání, ve kterém mu pomáhá jeho starý známý z Atlantis – seržant Bates. Honba začíná.

John dostává zprávu od Carterové, že jeho otec měl infarkt a umřel, vydává se proto na Zemi. Rodney musí opravit EMP generátor na M7G-677, ale jde s ním Ronon. Po příchodu na Zemi se všichni setkávají na rozloučení v domě jeho otce, kde také potká jeho bratra Dava, který přebírá jeho společnost. Později Shepparda osloví na baru jedna žena jménem Ava Dixonová, která tvrdí, že ví o událostech únosu Rodneyho a Jeannie. Odejdou a řekne jim o projektu Archetype, kde experimentovali s nanity a nakonec se jim podařilo vytvořit lidskou formu Replikátora. IOA to chtěla zarazit a když ho chtěli deaktivovat, zabil dvě stráže a utekl. Zatknou lídra projektu Poola a vyslýchají ho na Apollo, nechce ale moc spolupracovat. Doví se jen, že je imunní vůči ARG, ale má omezenou schopnost opravy. Pak ho vystupují v jednom skladišti, ale Replikátor Poola zabije a uniká jim jen s malým poškozením při velké palebné síle. Dr. Leeovi se poté povede dostat do Poolova počítače a jsou šokováni, když zjistí, že Ava je už delší dobu mrtvá, je tedy taky Replikátor. Později objeví, že je to jen jiný typ Replikátora, naprogramovaný převážně na sociální interakce a emoce. Sheppard cestuje do Washingtonu, kde mu Nancy dává informace o projektu. S novými informacemi ho najdou a musí vymyslet plán, jak ho zneškodnit.