S04E01: Scylla

Lincoln se dostává opět do potíží se zákonem, zatímco Michael vyhledává Gretchen, aby vykonal svou pomstu.

Whistler, Gretchen a Mahone jsou v L.A., kde navštěvují večírek, kde má Whistler vykonat svůj úkol. Tady také poprvé zjišťujeme, proč bylo důležité dostat Jamese z vězení. Měl domluvenou schůzku s Jasonem Liefem, který mu za 50 milionů dolarů předá kartu Scyllu, kde jsou veškeré informace o Společnosti. Whistler kartu dostává, nakopíruje si a Jasona zabíjí.

Gretchen a Whistler chtějí utéct, cestu jim ale zkříží Michael, který je připraven vykonat pomstu. Gretchen ale odvážně tvrdí, že Sára není mrtvá. Utekla jim, když jí věznili. Whistler s Gretchen utíkají a Michael se mezitím spojuje s Lincolnem v Panamě a vše mu říká.

V SONĚ se mezitím zbouřili vězni a všichni utekli. Bellick a Sucre se dostávají na svobodu, oba brzo vyzvedne Bellickova matka a odváží je do Států. Sucre hned míří za Maricruz, která už porodila díťě. Policie si ale myslela, že Sucre by mohl navštívit Maricruz a nemocnici hlídala. Sucre a Bellick jsou zatčeni.

T-Bag si mezitím užívá s bývalou Lecherovo jeptiškou, se kterou se také loučí. Jeptiška předá Bagwellovi peníze a T-Bag následně odjíždí s muži, kteří jsou ochotní pro něj pracovat. T-Bagovo cíl je zabít Scofielda. Chce se mu pomstít za vše, co mu kdysi udělal. Bagwell si ale najímá špaté muže a ti ho vzápětí okrádají o všechny peníze a nechávají ho v poušti.

Generál zjišťuje, že karta je pouze kopie a nechává Gretchen zabít. Na celou akci nasadí vysokého černocha jménem Wyatt, který se má postarat o Whistlera, Scofielda, Burrowse a Mahonea. Wyatt hned vyráží do Států, kde zabije Alexovu Pam.

Michael projíždí webovou stránku se vzkazy, kde mu píše muž, který má informace o Sáře. Michael je překvapen, když na schůzku přichází Mahone a Whistler. Ti byli celou dobu domluvení, že zničí Společnost a nyní mají Scyllu, pravou kartu o Společnosti. Na scéně se ale objevuje Wyatt, který Whistlera zabíjí a bere si pravou Scyllu, kterou předává „držiteli karty“.

Lincoln, Sofia a LJ si užívají život v Panamě. Brzo ale přichází muž ze Společnosti, který chce Lincolna zabít. Lincoln muže přemůže a zabije ho, vzápětí ho ale zatýká policie. Sofia a LJ utíkají. Mezitím v Chicagu je také zatčen Michael policií a čeká ho 15 let vězení.

Michael zjišťuje, že svůj trest smaže, když pomůže agentovi Donovi zničit Společnost. Don pracuje na zničení Společnosti už pět let, spolupracoval s Whistlerem, který mu měl předat pravou Scyllu. Michaelovo úkolem je najít kartu a vloupat se do budovy Společnosti, o které mluvil Whistler. Nikdo ale neví, kde by mohla být. Proto potřebují kartu a také ptačí encyklopedii.

Lincoln je převezen do Států, vše vyjednal agent Don Self. Celou kauci Michaela a Lincolna zaplatil Bruce Bennett, stárý známý Sáry, který také přivádí Sáru s sebou. Michael se konečně shledává se Sárou, která je v pořádku, ale má na sobě známky mučení.

Večer se pokusí Wyatt Michaela, Lincolna a Sáru zabít. Nyní mají všichni jasno – dokud nezničí Společnost, nebudou mít klid. Brzo se všichni schází s Donem, který s sebou přivádí i Sucrea, Bellicka a Mahonea, kteří jsou připraveni pomoc Michaelovi v plánu. Cíl je najít T-Baga a jeho knihu. Michael si nechává „ztrhnout“ tetování a všichni odlétají…